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Thèse en cours
La construction des polices d'Etat en Suisse occidentale. Acteurs, pratiques et images de la gendarmerie et de la police de sûreté dans le canton de Neuchâtel (1848-1914), sous la dirs. des Prof. Jean-Noël Luc (Université Paris IV-Sorbonne) et de Laurent Tissot (Université de Neuchâtel), (1ère inscription 2007).
Ouvrages
Pierre-Yves Donzé et Joël Jornod, L'industrie en images : un système technologique et industriel dans le Jura bernois, XIXe-XXIe siècle, recherches iconographiques et documentaires Philippe Hebeisen et Joël Jornod (CEJARE), Saint-Imier : CEJARE ; Neuchâtel : Editions Alphil, 2019, 500 p.
Werner Renfer, Œuvres complètes, vol. 2 : Entailles et profiles : 1925-1928, éd. de Patrick Amstutz, avec la collab. de Philippe Hebeisen et al., Gollion : Infolio; Porrentruy : AEPOL, 2018, 552 p. (Maison neuve).
Mido 1918-2018 : fidèle à ses valeurs depuis 100 ans [100 years], Le Locle : Mido SA, 2018.
Werner Renfer, Feuilles de l'aube : oeuvres complètes, vol. 1 : 1918-1925, éd. de Patrick Amstutz, avec la collab. de Philippe Hebeisen et al., Gollion : Infolio ; Porrentruy : AEPOL, 2017. (Maison neuve).
Une histoire de la frontière neuchâteloise durant la Seconde Guerre mondiale : administration et politique face aux réfugiés, Les Verrières (1939-1945), Neuchâtel, Editions Alphil, 2007. (lauréat de deux prix ; réédité en 2012).
Direction d'ouvrages
Clément Crevoisier (dir.), Philippe Hebeisen (éd.), Atlas historique du Jura, Porrentruy, Cercle d'études historiques de la Société jurassienne d'émulation, 2012.
Nicolas Barré, Philippe Hebeisen, Pierre-Olivier Léchot, Jean-Daniel Morerod (dir.), Le journal du pasteur Théophile Rémy Frêne, actes du colloque organisé à Tavannes le 4 juin 2005 sous le patronage du Cercle d'études historiques de la Société jurassienne d'Emulation, ASJE, 2006, pp. 145-231 (également publié en tiré à part).
Articles et contributions à des ouvrages collectifs
"The Swiss Army Gendarmerie: A Composite Force Facing the Challenges of the First World War", in Jonas Campion, Laurent López, Guillaume Payen (dirs.), European Police Forces and Law Enforcement in the First World War, London : Palgrave Macmillan, 2019 (World Histories of Crime, Culture and Violence), pp. 195-210
"Surveiller les montagnes ou réguler le territoire ? La mise en place du système policier neuchâtelois (1845-1857)", dans Aurélien Lignereux (dir.), Ordre, sécurité et secours en montagne. Police et territoire (XIXe-XXIe siècles), Fontaine, Presses universitaires de Grenoble (PUG), 2016, pp. 51-69.
"Les gendarmeries suisses dans la seconde moitié du XIXe siècle. Un modèle helvétique autoréférencé ?", dans Arnaud-Dominique Houte et Jean-Noël Luc (dir.), Les gendarmeries dans le monde, de la Révolution française à nos jours, Paris, Presses de l'université Paris-Sorbonne (PUPS), 2016, pp. 121-130.
"Gendarme suisse, une carrière civile ou militaire ? L'apport des Suisses de l'étranger dans l'interprétation de la « militarité" de la fonction policière (fin XIXe-début XXe s.) ", Annuaire suisse d'histoire économique et sociale / Schweizerisches Jahrbuch für Wirtschafts- und Sozialgeschichte, 29, 2015, pp. 127-143
" Vers un profil commun ? Recrutement et carrières des commandants cantonaux de gendarmerie au prisme de la prosopographie (Suisse romande, 1848-1914) ", Itinera, 32, 2012, pp. 159-175.
" Policiers suisses à l'étranger ", La Lettre de Penthes, n° 21, printemps 2013, pp. 32-37.
" Gendarmerie neuchâteloise : premier règlement et uniforme ", L'Express/L'Impartial, 3 août 2013.
" La naissance et la mise en place de la gendarmerie neuchâteloise : d'un corps civil original à l'institution militaire (1809-1850) ", Crime, Histoire & Sociétés / Crime, History & Societies, 2010, vol. 14, n° 1, pp. 73-93.
" Entre légitimation et reconnaissance : la réintroduction du serment de la gendarmerie neuchâteloise (1840) ", in Françoise Briegel (dir.), Sébastien Farré (dir.,éd.), Rites, hiérarchies, Chêne-Bourg : Georg, 2010, pp. 74-88.